De leden van MKB-Limburg worden ondergebracht in regionale afdelingen. Het bestuur van een afdeling kent de plaatselijke en regionale problemen en is het aanspreekpunt voor het College, de Gemeenteraad en de gemeenteambtenaren voor gemeentelijke en regionale zaken. Het afdelingsbestuur kan natuurlijk altijd op informatie en ondersteuning vanuit het Service Center rekenen.